ANÁLISE IN SILICO DO IMPACTO DA MUTAÇÃO MISSENSE P.HIS401GLN NO GENE PRKAG2 NAS AFINIDADES DA PROTEÍNA QUINASE ATIVADA POR AMP (AMPK) PELO AMP E ATP

Karine Terra de Souza; Jorge Hernandez Fernandez; Glauber Monteiro Dias

Título do Trabalho

Autores

Karine Terra de Souza
Jorge Hernandez Fernandez
Glauber Monteiro Dias

Modalidade

Resumo

Área temática

Eixo Temático 4 - Cidades, Desenvolvimento e Inovação

Data de Publicação

09/09/2024

País da Publicação

Brasil

Idioma da Publicação

Português

Página do Trabalho

https://www.even3.com.br/anais/xvi-confict-ix-conpg-445276/849459-analise-in-silico-do-impacto-da-mutacao-missense-phis401gln-no-gene-prkag2-nas-afinidades-da-proteina-quinase-at

ISBN

978-65-272-0687-3

Palavras-Chave

metadinâmica, AMPK, cardiomiopatia, PRKAG2

Resumo

A proteína quinase ativada por AMP (AMPK) é uma proteína heterotrimérica composta por uma subunidade catalítica (a) e duas subunidades regulatórias (ß e ?). A subunidade ? contém quatro repetições cistationina-ß-sintase que geram quatro locais potenciais de ligação a AMP, ADP ou ATP, nomeados sítios 1-4. Esta enzima monitora o estado energético celular, sendo ativada pelo aumento de AMP e/ou ADP e diminuição de ATP. A síndrome do PRKAG2 é uma doença genética resultante de mutações no gene da subunidade ?2 da AMPK cardíaca, causando cardiomiopatia. O trabalho visa identificar as afinidades da subunidade ?2 da AMPK selvagem e com a mutação missense (PRKAG2-p.His401Gln) pelos ligantes AMP e ATP. Com um modelo ?2 da AMPK humana, realizamos experimentos de metadinâmica no software Desmond com simulações de 60 ns no campo de força OPLS-2005. Coletamos duas variáveis: a distância percorrida por cada ligante até a zona de contato inicial com a proteína; e o diedro C-N-C-O entre a base nitrogenada e a ribose. A análise das variáveis foi estabelecida a partir de medições nos complexos proteína-AMP e proteína-ATP, para as estruturas selvagem e mutante. Os valores de energia livre (?G) obtidos foram comparados e as trajetórias foram visualizadas no Schrödinger Maestro. Na estrutura mutante, o ATP no sítio 3 tende a permanecer na zona de contato com a proteína, sendo energeticamente desfavorável a sua acomodação no sítio. Na estrutura selvagem, o ATP no mesmo sítio prefere se acomodar no sítio de ligação. No entanto, não há diferença estatisticamente significativa entre os complexos de acordo com a análise de variância (ANOVA) do ?G. Novos experimentos de dinâmica essencial serão realizados com a subunidade gama e com a proteína completa para estudar a relação entre a dinâmica dos domínios da subunidade e a acomodação dos ligantes.

Título do Evento: XVI CONFICT / IX CONPG
Cidade do Evento: Campos dos Goytacazes
Título dos Anais do Evento: Anais do XVI Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica e IX Congresso Fluminense de Pós-Graduação
Nome da Editora: Even3
Meio de Divulgação: Meio Digital

Como citar

SOUZA, Karine Terra de; FERNANDEZ, Jorge Hernandez; DIAS, Glauber Monteiro. ANÁLISE IN SILICO DO IMPACTO DA MUTAÇÃO MISSENSE P.HIS401GLN NO GENE PRKAG2 NAS AFINIDADES DA PROTEÍNA QUINASE ATIVADA POR AMP (AMPK) PELO AMP E ATP.. In: Anais do XVI Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica e IX Congresso Fluminense de Pós-Graduação. Anais...Campos dos Goytacazes(RJ) UENF, 2024. Disponível em: https//www.even3.com.br/anais/xvi-confict-ix-conpg-445276/849459-ANALISE-IN-SILICO-DO-IMPACTO-DA-MUTACAO-MISSENSE-PHIS401GLN-NO-GENE-PRKAG2-NAS-AFINIDADES-DA-PROTEINA-QUINASE-AT. Acesso em: 05/05/2025