UMA ABORDAGEM TRANSCRIPTÔMICA SOBRE A MICROESPOROGÊNESE EM CYPERACEAE E OUTRAS ANGIOSPERMAS

Publicado em 11/12/2024 - ISBN: 978-65-272-1024-5

Título do Trabalho
UMA ABORDAGEM TRANSCRIPTÔMICA SOBRE A MICROESPOROGÊNESE EM CYPERACEAE E OUTRAS ANGIOSPERMAS
Autores
  • Letícia Maria Parteka
  • Rafael de Assis
  • Danilo Massuia Rocha
Modalidade
Resumo (poster)
Área temática
RNA e transcriptômica
Data de Publicação
11/12/2024
País da Publicação
Brasil
Idioma da Publicação
Português
Página do Trabalho
https://www.even3.com.br/anais/epbioinfo2024/969250-uma-abordagem-transcriptomica-sobre-a-microesporogenese-em-cyperaceae-e-outras-angiospermas
ISBN
978-65-272-1024-5
Palavras-Chave
Micrósporos, Grão de Pólen, Proteínas de Choque Térmico, Arabidopsis.
Resumo
O desenvolvimento de micrósporos e grãos de pólen é essencial para a produção de frutos e sementes, mas é também altamente vulnerável a estresses, o que torna fundamental sua investigação. Embora este desenvolvimento seja conservado nas angiospermas, alguns grupos apresentam particularidades. Neste sentido, Cyperaceae foi usada como modelo para este estudo, pois apresenta meiose assimétrica com a degeneração de três produtos meióticos para formação de um único micrósporo funcional, o qual irá gerar o grão de pólen. Contudo, apesar desta particularidade, nada se sabe sobre a expressão gênica durante este processo. Assim, este trabalho visou estimar, por bioinformática, a expressão gênica de fatores potenciais envolvidos na peculiar microesporogênese em Cyperaceae com base em dados transcriptômicos. Para tal, RNAseq de micrósporos de Rhynchospora pubera (Cyperaceae), Luzula elegans (Juncaceae) e Arabidopsis thaliana (Brassicaceae) foram obtidos do European Nucleotide Archive e transcriptomas foram montados utilizando o rnaSPAdes. Genes de interesse foram selecionados para compor bancos de dados, os quais foram utilizados para identificação dos contigs por BLASTn local. Em seguida, foram selecionados e quantificados, em transcritos por milhão (Transcripts per Million - TPM), apenas os contigs com identidade acima de 95% com o gene de interesse. O programa Kallisto foi utilizado para esta quantificação. Para a normalização, foram testadas normalização pelo total de TPM e por genes de referência, como ubiquitina 6 (UBQ6). Neste último caso, o total de TPM de cada gene de interesse foi dividido pelo total de TPM do gene de referência. Os métodos descritos foram realizados na plataforma Galaxy. O gene HSP70 se destacou nas análises, estando ele relacionado à resistência ao estresse térmico, com seu produto acumulado na microesporogênese de modo geral. Entretanto, esse gene parece ter uma expressão acentuada em R. pubera, sugerindo maior resistência a esse tipo de estresse, que afeta micrósporos e grãos de pólen mais do que qualquer outra parte do ciclo de vida da planta. Além disso, ele também pode estar relacionado a alguns tipos de sinalização de morte celular programada. Genes relacionados à autofagia também se destacaram no transcriptoma de R. pubera. A expressão de HSP70 e genes de autofagia sugerem maior concentração de recursos para o micrósporo funcional e maior termotolerância do pólen. Foram identificados também RNAs relativos às proteínas SOSEKI, altamente conservadas em plantas terrestres e relativamente mais presentes em R. pubera. Essas proteínas polimerizam assimetricamente na membrana plasmática e recrutam efetores de polarização celular de maneira dependente de concentração. A expressão de SOSEKI em R. pubera sugere a reutilização de mecanismos celulares bem estabelecidos evolutivamente nas plantas terrestres para formação de uma microesporogênese assimétrica de Cyperaceae. Pela primeira vez, foi possível relacionar a expressão gênica com a microesporogênese em Cyperaceae. Este estudo abre caminho para investigação de mecanismos moleculares envolvidos em assimetria e morte celular programada, além da adaptação de grãos de pólen ao estresse térmico, um tema relevante diante das atuais mudanças climáticas.
Título do Evento
Escola Paranaense de Bioinformática
Cidade do Evento
Londrina
Título dos Anais do Evento
Anais da Escola Paranaense de Bioinformática
Nome da Editora
Even3
Meio de Divulgação
Meio Digital

Como citar

PARTEKA, Letícia Maria; ASSIS, Rafael de; ROCHA, Danilo Massuia. UMA ABORDAGEM TRANSCRIPTÔMICA SOBRE A MICROESPOROGÊNESE EM CYPERACEAE E OUTRAS ANGIOSPERMAS.. In: Anais da Escola Paranaense de Bioinformática. Anais...Londrina(PR) UEL, 2024. Disponível em: https//www.even3.com.br/anais/epbioinfo2024/969250-UMA-ABORDAGEM-TRANSCRIPTOMICA-SOBRE-A-MICROESPOROGENESE-EM-CYPERACEAE-E-OUTRAS-ANGIOSPERMAS. Acesso em: 06/07/2025

Trabalho

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