ANÁLISE METAGENÔMICA DO MICROBIOMA DE INTESTINO DO CUPIM H. LONGICEPS

Gilson Ely Leite Filho; Fabiano Thompson; Wanderley de Souza; Marlene Benchimol; Diogo Antonio Tschoeke

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Trabalho

Título do Trabalho

ANÁLISE METAGENÔMICA DO MICROBIOMA DE INTESTINO DO CUPIM H. LONGICEPS

Autores

Gilson Ely Leite Filho
Fabiano Thompson
Wanderley de Souza
Marlene Benchimol
Diogo Antonio Tschoeke

Modalidade

Resumo

Área temática

Structural Bioinformatics

Data de Publicação

08/09/2022

País da Publicação

Brasil

Idioma da Publicação

Português

Página do Trabalho

https://www.even3.com.br/anais/epbioinfo2022/515617-analise-metagenomica-do-microbioma-de-intestino-do-cupim-h-longiceps

ISBN

978-65-5941-801-5

Palavras-Chave

Metagenômica, Microbioma, Intestino, Cupim, H.longiceps

Resumo

O microbioma de cupins apresenta uma grande diversidade de microrganismos que desempenham funções fundamentais para o seu desenvolvimento, como, por exemplo, a capacidade de protozoários digerir a lignocelulose, o que torna uma relação de mutualismo. Em geral, os cupins são comumente classificados de acordo com o seu microbioma intestinal, o tipo de dieta e o habitat. A espécie Heterotermes longiceps, alvo de estudo deste trabalho, é um cupim subterrâneo da família Rhinotermitidae, abundante em toda a América do Sul, com ampla distribuição geográfica, encontrados em ambientes naturais e urbanos. Estão frequentemente relatados a pragas agrícolas e estruturais, o que demonstra uma importância economicamente. Nosso trabalho, tem como objetivo identificar taxonomicamente e funcionalmente a diversidade do microbioma presente no intestino do cupim H. longiceps. Para isso, foi utilizada a técnica de metagenômica total, amplamente utilizada em casos de identificação de microrganismos inviáveis para cultivo em laboratório. Dessa forma, foi realizada a extração total do DNA presente no intestino e o seu respectivo sequenciamento através da plataforma Illumina. Utilizou-se o programa Fastqc para verificar a qualidade das sequências, nas quais foram ainda processadas por meio do Prinseq (Qphred > 30 e >50nt). As sequências resultantes, foram montadas com o programa Spades. As predições dos genes e das sequências de proteínas, a partir dos contigs gerados, foi realizada pelo programa Prodigal. Essas sequências preditas foram analisadas pelo software Diamond, para busca por similaridade contra o banco de dados de proteínas NR do GenBank. A partir destes resultados obtidos, foi realizado o mapeamento dos microrganismos e abundâncias com o programa MEGAN6. Dentre os microrganismos identificados, foi observado uma predominância de bactérias no microbioma, com 261.090 proteínas, sendo 48,52% da amostra, ao nível de filo, abundância observada foi para para de Spirochaetes (22,28%), seguido de Bacteroidetes (8,16%) Firmicutes (7,33%) e Proteobacteria (6,06%). Ao nível de Gênero, foi observado a predominância de Treponema (21,2%). O domínio Archaea representou apenas 0,14% da amostra (764 proteínas). Enquanto Eucaryota com 3183 proteínas representou 0,59% da amostra. Encontramos também alguns protozoários, ao nível de gênero holomastigotoides (0,01%) trichomonas (0,13%), tritrichomonas (0,28%), streblomastix: (0,02%). Podemos concluir que o microbioma da espécie estudada é bastante diverso, composto em sua maioria por bactérias, apresentando, entretanto, alguns protozoários importantes que podem ter o papel de degradação de celulose. Spirochaetes foi obeservada em maior quantidade, o que corrabora com a relação já demonstrada anteriormente deste Filo em outras espécies que possuem uma alimentação de madeira.

Título do Evento: Escola Paranaense de Bioinformática
Cidade do Evento: Curitiba
Título dos Anais do Evento: Anais da Escola Paranaense de Bioinformática (EPB)
Nome da Editora: Even3
Meio de Divulgação: Meio Digital

Como citar

FILHO, Gilson Ely Leite et al.. ANÁLISE METAGENÔMICA DO MICROBIOMA DE INTESTINO DO CUPIM H. LONGICEPS.. In: Anais da Escola Paranaense de Bioinformática (EPB). Anais...Curitiba(PR) UFPR/SEPT, 2022. Disponível em: https//www.even3.com.br/anais/epbioinfo2022/515617-ANALISE-METAGENOMICA-DO-MICROBIOMA-DE-INTESTINO-DO-CUPIM-H-LONGICEPS. Acesso em: 16/07/2025