INFERÊNCIA DE ÁRVORES FILOGENÉTICAS UTILIZANDO A ANÁLISE DE REDES COMPLEXAS

Tatiana Mari Saita; Glaucia Maria Bressan; Fabricio Martins Lopes

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Trabalho

Título do Trabalho

INFERÊNCIA DE ÁRVORES FILOGENÉTICAS UTILIZANDO A ANÁLISE DE REDES COMPLEXAS

Autores

Tatiana Mari Saita
Glaucia Maria Bressan
Fabricio Martins Lopes

Modalidade

Resumo

Área temática

Phylogeny and Evolution

Data de Publicação

08/09/2022

País da Publicação

Brasil

Idioma da Publicação

Português

Página do Trabalho

https://www.even3.com.br/anais/epbioinfo2022/511588-inferencia-de-arvores-filogeneticas-utilizando-a-analise-de-redes-complexas

ISBN

978-65-5941-801-5

Palavras-Chave

redes complexas, árvore filogenética, métrica de similaridade

Resumo

Técnicas computacionais têm ganhado importância em diversas áreas devido a alta capacidade de processamento e tempo de resposta mais rápidos. Um exemplo se encontra na Biologia Molecular, com a demanda de análise de um crescente volume de dados principalmente genômicos (genes) e transcriptômicos (RNAs). Os modelos gerados, chamados “in silico”, são cada vez mais utilizados na compreensão dos processos biológicos. No contexto da filogenia, a inferência de árvores filogenéticas, estruturas que auxiliam na interpretação das relações de proximidade, grau de parentesco e possíveis ancestrais em comum em um grupo de espécies, tem sido utilizada em diversas aplicações, como a determinação de novas espécies de bactérias e na compreensão de processos evolutivos presentes em organismos. Para isso, a comparação genética de espécies pode ser realizada em um gene específico, como na técnica que utiliza o gene 16S rRNA (presente em todos os seres vivos), ou comparando vários genes, como o método MLSA (Multi-locus Sequence Analysis). Tais métodos restringem a análise da sequência por meio de alinhamento, podendo não reconhecer características que diferenciam, por exemplo, espécies muito próximas em uma árvore filogenética. Para aumentar a eficiência na comparação, técnicas computacionais aliadas a Teoria de Redes Complexas, como o método BASiNET representam sequências gênicas utilizando redes complexas que podem ser comparadas aplicando métricas de similaridade, permitindo uma análise específica de propriedades e a classificação de organismos por meio de árvores filogenéticas que representam com maior especificidade a relação entre as espécies. Além disso, outra vantagem desse método é o cálculo de métricas de similaridade de redes possuírem custo computacional baixo comparados a outras técnicas de análise comparativa de genes. Este trabalho propõe a caracterização de sequências genômicas por redes complexas e a inferência de árvores filogenéticas por meio da estimação de medidas de similaridade entre as redes a fim de obter uma relação entre os genes comparados.

Título do Evento: Escola Paranaense de Bioinformática
Cidade do Evento: Curitiba
Título dos Anais do Evento: Anais da Escola Paranaense de Bioinformática (EPB)
Nome da Editora: Even3
Meio de Divulgação: Meio Digital

Como citar

SAITA, Tatiana Mari; BRESSAN, Glaucia Maria; LOPES, Fabricio Martins. INFERÊNCIA DE ÁRVORES FILOGENÉTICAS UTILIZANDO A ANÁLISE DE REDES COMPLEXAS.. In: Anais da Escola Paranaense de Bioinformática (EPB). Anais...Curitiba(PR) UFPR/SEPT, 2022. Disponível em: https//www.even3.com.br/anais/epbioinfo2022/511588-INFERENCIA-DE-ARVORES-FILOGENETICAS-UTILIZANDO-A-ANALISE-DE-REDES-COMPLEXAS. Acesso em: 27/06/2025