DIVERSIDADE GENÉTICA VIA MARCADORES MOLECULAR SNP EM CAFEEIROS AMAZÔNICOS

Ana Carolina Andrade Silva; Eveline Teixeira Caixeta; Letícia De Faria Silva; Alexsandro Lara Teixeira; Rodrigo Rocha; Bruno Grespan Leichtweis

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Trabalho

Título do Trabalho

DIVERSIDADE GENÉTICA VIA MARCADORES MOLECULAR SNP EM CAFEEIROS AMAZÔNICOS

Autores

Ana Carolina Andrade Silva
Eveline Teixeira Caixeta
Letícia De Faria Silva
Alexsandro Lara Teixeira
Rodrigo Rocha
Bruno Grespan Leichtweis

Modalidade

Resumo

Área temática

Melhoramento de Espécies Perenes

Data de Publicação

21/09/2023

País da Publicação

Brasil

Idioma da Publicação

Português

Página do Trabalho

https://www.even3.com.br/anais/12cbmp/662390-diversidade-genetica-via-marcadores-molecular-snp-em-cafeeiros-amazonicos

ISBN

978-85-5722-993-8

Palavras-Chave

Coffea canephora, melhoramento genético, grupos varietais

Resumo

A cafeicultura da região Amazônica apresenta grande relevância na produção de café e na economia do Brasil. As lavouras desta região se desenvolveram a partir da espécie Coffea canephora, com cultivo das variedades botânicas Conilon e Robusta. Híbridos derivados do cruzamento entre as variedades botânicas também foram formados, aproveitando a heterose manifestada nestes cruzamentos. Apesar da importância dessa espécie, a sustentabilidade do cultivo está exposta a estresses bióticos e abióticos, tais como presença de pragas, doenças e mudanças climáticas. Conhecer a diversidade genética existente nos recursos genéticos disponíveis pode auxiliar a enfrentar esses desafios. Estudos de diversidade genética com marcadores moleculares SNP são escassos em C. canephora. Além disso, há um pequeno número de SNP disponíveis para a espécie, quando comparadas com outras culturas de relevância econômica. A Embrapa Rondônia é mantenedora de um banco de germoplasma (BAG) de C. canephora e também caracteriza clones desenvolvidos por cafeicultores do estado de Rondônia. Diante do exposto, o objetivo do trabalho foi avaliar a diversidade genética de cafeeiros provenientes do programa de melhoramento da Embrapa-RO juntamente com genótipos de produtores locais, via marcadores moleculares SNP. Foram analisados 144 cafeeiros com cerca de 108.000 SNP genotipados pela metodologia Capture-Seq da Empresa Rapid Genomics (Flórida-EUA). Após análises de qualidade, 39.330 SNPs foram utilizados para a análise. Uma matriz de dissimilaridade genética foi gerada utilizando os dados moleculares dos SNPs e a partir dos valores da matriz de distância foi obtido um dendrograma, utilizando a técnica de agrupamento UPGMA. Observou-se a formação de cinco grupos. O grupo I e o grupo IV foram formados por apenas dois cafeeiros cada, sendo, portanto, os que mais divergem dos demais cafeeiro. O grupo II foi composto por 34 cafeeiros, apresentando uma concentração de cafeeiros Robustas pertencentes ao BAG da Embrapa-RO. O grupo III foi formado por 18 cafeeiros e alocou a maioria dos cafeeiros Conilon pertencentes ao BAG da Embrapa-RO. O último e maior grupo, V, ficou composto por 88 cafeeiros, de sua maioria híbridos e genótipos de produtores locais. O conjunto de marcadores moleculares SNPs utilizados foram capazes de discriminar os cafeeiros da espécie C. canephora no presente estudo. A partir dessas informações é possível direcionar cruzamentos promissores, explorando a heterose manifestada nos cruzamentos intervarietais. Com isso, é possível ampliar a base genética existente, acelerar o processo de melhoramento genético de C. canephora e obter materiais que mantenham a sustentabilidade do cultivo mesmo sob condições adversas de estresses bióticos e abióticos.

Título do Evento: 12º Congresso Brasileiro de Melhoramento de Plantas 2023
Cidade do Evento: Caxambu
Título dos Anais do Evento: Anais do 12º Congresso Brasileiro de Melhoramento de Plantas
Nome da Editora: Even3
Meio de Divulgação: Meio Digital

Como citar

SILVA, Ana Carolina Andrade et al.. DIVERSIDADE GENÉTICA VIA MARCADORES MOLECULAR SNP EM CAFEEIROS AMAZÔNICOS.. In: Anais do 12º Congresso Brasileiro de Melhoramento de Plantas. Anais...Caxambu(MG) Hotel Glória, 2023. Disponível em: https//www.even3.com.br/anais/12cbmp/662390-DIVERSIDADE-GENETICA-VIA-MARCADORES-MOLECULAR-SNP-EM-CAFEEIROS-AMAZONICOS. Acesso em: 06/06/2025