TRIAGEM VIRTUAL DE POTENCIAIS INIBIDORES DA RNA POLIMERASE DEPENDENTE DE RNA (RDRP) DO SARS-COV-2 PARA A DESCOBERTA DE NOVOS ANTIVIRAIS

Publicado em 22/03/2021 - ISBN: 978-65-5941-128-3

Título do Trabalho
TRIAGEM VIRTUAL DE POTENCIAIS INIBIDORES DA RNA POLIMERASE DEPENDENTE DE RNA (RDRP) DO SARS-COV-2 PARA A DESCOBERTA DE NOVOS ANTIVIRAIS
Autores
  • João Pedro Neves de Mello
  • Caroline Reis Santiago Paschoal
  • Vitor Won-Held Rabelo
  • Helena Carla Castro
  • Izabel Christina Nunes de Palmer Paixão
  • DAIANE DE JESUS VIEGAS
  • Paula Alvarez Abreu
Modalidade
Resumo apresentação oral curta
Área temática
Campus Macaé/Farmácia
Data de Publicação
22/03/2021
País da Publicação
Brasil
Idioma da Publicação
Português
Página do Trabalho
https://www.even3.com.br/anais/jgmictac/319950-triagem-virtual-de-potenciais-inibidores-da-rna-polimerase-dependente-de-rna-(rdrp)-do-sars-cov-2-para-a-descober
ISBN
978-65-5941-128-3
Palavras-Chave
SARS-COV-2, COVID-19, RdRP, molecular docking, virtual screening
Resumo
O mundo vive uma grande crise de saúde devido ao novo Coronavírus SARS-CoV-2, agente etiológico da COVID-19 (WHO, 2020). Remdesevir, que é um agente antiviral de amplo espectro e tem atividade in vitro contra vários vírus de RNA, é um dos principais antivirais testados para o tratamento da COVID-19 (SANDRES, 2020). A RdRp apresenta-se como um alvo ideal devido ao seu papel crucial na síntese de RNA, falta de homólogo no hospedeiro e alta conservação estrutural (PRUIJSSERS, 2019). Assim, o objetivo deste estudo foi identificar novos inibidores potenciais de RdRP com possibilidade de apresentarem atividade antiviral contra SARS-CoV-2. Inicialmente, o cristal de RdRp disponível no Proteina Data Bank (PDB) foi obtido e o modo de ligação e as interações com o ligante RDV foram avaliados. A partir dessas informações, usando o servidor Pharmit, um modelo de farmacóforo foi construído com base em interações importantes. Ainda no Pharmit, o modelo farmacofórico foi utilizado para realizar uma triagem virtual nos bancos de dados de medicamentos da empresa Sigma-Aldrich, medicamentos aprovados pelo FDA, e do Núcleo de Bioensaios, Biossíntese e Ecofisiologia de Produtos Naturais (Nubbe). Para validação de docking, foi feito o redocking do RDV co-cristalizado em RdRp. Assim, as substâncias de triagem foram submetidas ao docking molecular na RdRp por meio do programa Autodock 4. As substâncias com menor energia de ligação tiveram suas poses e interações avaliadas nos programas Pymol 1.5.6 e Discovery Studio. As substâncias que obedeceram ao farmacóforo e interagiram de maneira semelhante ao inibidor de RDV foram avaliadas quanto à farmacocinética e toxicidade usando os servidores FAF-drug4, admetSAR 2 e pkCSM. A partir da triagem com o farmacóforo, foram obtidas 224 substâncias do banco Sigma-Aldrich, 186 medicamentos aprovados pela FDA e 44 produtos naturais da Nubbe. O redocking RDV apresentou valor de RMSD 1,22, validando o método e parâmetros utilizados. Após a inspeção visual para verificar a pose e as interações, 33 substâncias se mostraram promissoras. Finalmente, após filtrar as propriedades farmacocinéticas e toxicológicas, 2 medicamentos, 4 produtos naturais e 10 substâncias da empresa Sigma-Aldrich foram selecionados. Neste estudo in silico, esses compostos mostraram-se potenciais inibidores da enzima RdRp. Essas substâncias são candidatas promissoras a serem antivirais contra esse vírus. Essas substâncias serão testadas in vitro no vírus SARS-COV-2. Os testes serão realizados por grupos colaboradores da Universidade Federal Fluminense. PRUIJSSERS, A. J. DENISON, M.R. Nucleoside analogues for the treatment of coronavirus infections. Curr. Opin. Virol. 2019;35:57–62. SANDRES, J. M. MONOGUE, M. L. et al. Pharmacologic Treatments for Coronavirus Disease 2019 (COVID-19). A Review. JAMA, 2020. WORLD HEALTH ORGANIZATION. WHO Coronavirus Disease (COVID-19) Dashboard. Disponível em: https://covid19.who.int/>. Acesso em 10 de dezembro de 2020.
Título do Evento
XLII Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Tecnológica, Artística e Cultural (JICTAC 2020 - Edição Especial) - Evento UFRJ
Título dos Anais do Evento
Anais da Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Tecnológica, Artística e Cultural
Nome da Editora
Even3
Meio de Divulgação
Meio Digital

Como citar

MELLO, João Pedro Neves de et al.. TRIAGEM VIRTUAL DE POTENCIAIS INIBIDORES DA RNA POLIMERASE DEPENDENTE DE RNA (RDRP) DO SARS-COV-2 PARA A DESCOBERTA DE NOVOS ANTIVIRAIS.. In: Anais da Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Tecnológica, Artística e Cultural. Anais...Rio de Janeiro(RJ) UFRJ, 2021. Disponível em: https//www.even3.com.br/anais/jgmictac/319950-TRIAGEM-VIRTUAL-DE-POTENCIAIS-INIBIDORES-DA-RNA-POLIMERASE-DEPENDENTE-DE-RNA-(RDRP)-DO-SARS-COV-2-PARA-A-DESCOBER. Acesso em: 08/02/2025

Trabalho

Even3 Publicacoes