Anais da Escola Paranaense de Bioinformática (EPB)

IDENTIFICAÇÃO DE REGIÕES HIPERVARIÁVEIS NO PLASTOMA DE COCOSEAE

Publicado em 08/09/2022 - ISBN: 978-65-5941-801-5

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Trabalho
Título do Trabalho
IDENTIFICAÇÃO DE REGIÕES HIPERVARIÁVEIS NO PLASTOMA DE COCOSEAE
Autores
  • Raquel Santos da Silva
  • Charles Roland Clement
  • Eduardo Balsanelli
  • Valter A. de Baura
  • Emanuel Maltempi de Souza
  • Hugo Fraga
  • Leila do Nascimento vieira
Modalidade
Resumo
Área temática
Phylogeny and Evolution
Data de Publicação
08/09/2022
País da Publicação
Brasil
Idioma da Publicação
pt-BR
Página do Trabalho
https://www.even3.com.br/anais/epbioinfo2022/513354-identificacao-de-regioes-hipervariaveis-no-plastoma-de-cocoseae
ISBN
978-65-5941-801-5
Palavras-Chave
Filogenômica, Palmeiras, Plastomas.
Resumo
A família Arecaceae é amplamente distribuída entre as regiões tropicais e subtropicais do mundo e fornece vários produtos com grande importância econômica e ecológica. A subfamília Arecoideae é considerada sua maior representante e a tribo Cocoseae possui três subtribos: Attaleinae, Bactridinae e Elaeidinae, que apresentam algumas relações intergenéricas ambíguas entre si. Os genomas plastidiais são utilizados como ferramenta para estudos evolutivos, devido a sua estrutura conservada e não recombinante. Regiões hipervariáveis do genoma plastidial, podem fornecer informações para esclarecer relações filogenéticas não resolvidas. Deste modo, o objetivo foi identificar as regiões hipervariáveis no genoma plastidial de espécies das três subtribos de Cocoseae, para confirmar as relações intergenicas e a monofília de Bactridinae. Foi realizada a identificação das regiões hipervariáveis nas três subtribos de Cocoseae. Para identificar as regiões com maior variação foi realizada a estimativa de SV% (variação em sequência) e PIS% (sítios parcimoniosos informativos ). Os plastomas das espécies da tribo Cocoseae são bem conservados, com identidade de 97,3%. A SV% e os PIS% apresentaram maior variação do que os marcadores moleculares plastidiais comumente utilizados em análises filogenéticas de palmeiras. O uso combinado das regiões plastidiais descritas e dos marcadores nucleares PRK e RPB2 tem um grande potencial para estudos filogenéticos na tribo Cocoseae. Assim, foram descritas quatro novas regiões promissoras com base nos valores de SV% e PIS%, uma nova região baseada em SV% e três novas regiões baseadas em PIS%. As análises filogenéticas apresentaram topologia idêntica e consistente dentro da tribo Cocoseae, confirmando o monofiletismo das subtribos Bactridinae e Attaleinae. Com a caracterização destas novas regiões, será possível realizar novos estudos comparativos com outras espécies de palmeiras.
Título do Evento
Escola Paranaense de Bioinformática
Cidade do Evento
Curitiba
Título dos Anais do Evento
Anais da Escola Paranaense de Bioinformática (EPB)
Nome da Editora
Even3
Meio de Divulgação
Meio Digital

Como citar

SILVA, Raquel Santos da et al.. IDENTIFICAÇÃO DE REGIÕES HIPERVARIÁVEIS NO PLASTOMA DE COCOSEAE.. In: Anais da Escola Paranaense de Bioinformática (EPB). Anais...Curitiba(PR) UFPR/SEPT, 2022. Disponível em: https//www.even3.com.br/anais/epbioinfo2022/513354-IDENTIFICACAO-DE-REGIOES-HIPERVARIAVEIS-NO-PLASTOMA-DE-COCOSEAE. Acesso em: 21/04/2026

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