CARACTERIZAÇÃO GENÔMICA E ANÁLISE IN SILICO DE VARIANTES DE SIGNIFICADO INCERTO EM CÂNCER HEREDITÁRIO: EVIDÊNCIAS DE UMA COORTE DO SUL DO BRASIL

Fernanda Arissa Takii; Gabriel Dziurkovski Machado; Salmo Raskin; Liya Regina Mikami

Título do Trabalho

Autores

Fernanda Arissa Takii
Gabriel Dziurkovski Machado
Salmo Raskin
Liya Regina Mikami

Modalidade

Resumo

Área temática

Epidemiológico

Data de Publicação

20/04/2026

País da Publicação

Brasil

Idioma da Publicação

pt-BR

Página do Trabalho

https://www.even3.com.br/anais/conciam-523357/1298741-caracterizacao-genomica-e-analise-in-silico-de-variantes-de-significado-incerto-em-cancer-hereditario--evidencia

ISBN

978-65-272-2354-2

Palavras-Chave

Variação Genética, Genes Supressores de Tumor, Síndromes Neoplásicas Hereditárias

Resumo

INTRODUÇÃO: As tecnologias de sequenciamento genético têm ampliado a capacidade de identificar casos de predisposição hereditária ao câncer, como de mama e ovário hereditário. Entretanto, este avanço acompanhou o aumento na detecção de variantes genéticas de significado clínico incerto (VUS), que representam um desafio, dada a escassez de dados na literatura – esta dificuldade é amplificada em populações miscigenadas, como a brasileira. Neste contexto, modelos computacionais de predição in silico surgem como ferramentas úteis na avaliação de VUS para estimar seu impacto funcional e patogênico nas proteínas transcritas. OBJETIVOS: Mapear variantes genéticas encontradas em indivíduos do sul do Brasil encaminhados para investigação de câncer de mama e ovário hereditário e analisar o impacto funcional das VUS por meio de ferramentas computacionais in silico. METODOLOGIA: Este estudo retrospectivo faz parte de uma coorte conduzida entre 2006 e 2024 em uma clínica de referência em exames genéticos de Curitiba/PR. Foram analisados os resultados de testes genéticos de 440 indivíduos com suspeita de câncer de mama e ovário hereditário. As VUS de sentido trocado (missense) foram analisadas posteriormente usando o software de predição in silico PolyPhen-2 para estimar os impactos funcionais em proteínas transcritas. RESULTADOS: Um total de 147 variantes foram identificadas em 28 genes, sendo BRCA1 (25,2%) e BRCA2 (21,1%) as mais frequentes, seguidas por CHEK2 e ATM (6,8% cada). Esta análise revelou 60 variantes patogênicas ou provavelmente patogênicas (P/LP – 40,8%), 7 benignas ou provavelmente benignas (B/LB – 4,8%) e 80 VUS (54,4%). As 60 variantes P/LP identificadas estão distribuídas em 12 genes, sendo que BRCA1 (48,3%) e BRCA2 (26,7%) predominaram. 33,3% eram de impacto molecular sem sentido (nonsense), 30,0% de mudança na matriz de leitura (frameshift) e 20,0% missense. Entre as 80 VUS identificadas em 26 diferentes genes, as mais frequentes foram em BRCA2 (16,3%), CHEK2 e ATM (10,0% cada) e BRCA1 (7,5%). As variantes missense representaram 85% dessas VUS. Uma análise mais aprofundada utilizando o PolyPhen-2 nas 68 VUS do tipo missense mostrou que 39,7% das variantes foram classificadas como benignas, 16,2% como possivelmente prejudiciais e 35,3% como provavelmente prejudiciais. A pontuação média do PolyPhen-2 foi de 0,541 (±0,44), com sensibilidade mediana de 0,875 (±0,21) e especificidade de 0,910 (±0,01). Esta análise também identificou oito variantes nunca descritas anteriormente na literatura sobre câncer, incluindo três deleções de exons (exons 4-6 de BRCA1, exons 62-63 de ATM, exons 5-6 de BRIP1) e cinco outras variantes – BRCA2 c.1796_1800delCTTAT e c.8682del, BRCA1 c.5137+2T>C, CLCA2 c.1195G>T e TP53 IVS02+36C>T. CONCLUSÃO: A abordagem de pacientes portadores de VUS é um desafio na oncogenética – desconsiderar prematuramente uma VUS pode ser precipitado, enquanto agir com base nela sem evidências suficientes pode levar a resultados adversos ao paciente. Isso ressalta a importância de uma melhor compreensão do perfil genético brasileiro e caracterização de VUS usando outros preditores para aprimorar o cuidado ao paciente.

Título do Evento: Conciam
Cidade do Evento: Curitiba
Título dos Anais do Evento: Anais do Conciam
Nome da Editora: Even3
Meio de Divulgação: Meio Digital

Como citar

TAKII, Fernanda Arissa et al.. CARACTERIZAÇÃO GENÔMICA E ANÁLISE IN SILICO DE VARIANTES DE SIGNIFICADO INCERTO EM CÂNCER HEREDITÁRIO: EVIDÊNCIAS DE UMA COORTE DO SUL DO BRASIL.. In: Anais do Conciam. Anais...Curitiba(PR) AMP, 2025. Disponível em: https//www.even3.com.br/anais/conciam-523357/1298741-CARACTERIZACAO-GENOMICA-E-ANALISE-IN-SILICO-DE-VARIANTES-DE-SIGNIFICADO-INCERTO-EM-CANCER-HEREDITARIO--EVIDENCIA. Acesso em: 22/05/2026